急性扁桃体炎具有传染性，可通过飞沫或者直接接触而感染他人。炎症累及周围组织会引起相关炎症，如急性中耳炎、急性鼻炎喉炎等;还会引起全身多系统疾病，如急性风湿热、心肌炎、急性肾炎等。

慢性扁桃体炎患者由于隐窝长期厌氧菌感染、腐败物潴留，易出现口臭。造成患儿扁桃体过度肥大，影响睡眠，造成吞咽或言语共鸣障碍。还会导致患者消化不良、头痛、低热乏力等全身反应。

慢性扁桃体炎易出现并发症，如：风湿性关节炎、风湿热、心脏病及肾炎等。